Forskningsingenjör till Clinical Genomics Umeå

Umeå universitet är ett av Sveriges största lärosäten med över 41 500 studenter och cirka 4 600 anställda. Vid universitetet finns en mångfald av utbildningar av hög kvalitet och världsledande forskning inom flera vetenskapsområden, och här gjordes den banbrytande upptäckten av gensaxen CRISPR-Cas9 som tilldelats Nobelpriset i kemi. Vid Umeå universitet är allt nära. Våra sammanhållna campus gör det lätt att mötas, samarbeta och utbyta kunskap, något som gynnar en dynamisk och öppen kultur.

Den samhällsomvandling och de stora gröna investeringar vi ser i norra Sverige skapar enorma möjligheter och komplexa utmaningar. För Umeå universitet handlar det om att bedriva forskning om – och mitt i – ett samhälle i omvandling. Men också om att leverera utbildningar för regioner som behöver expandera fort och hållbart. Det är helt enkelt här framtiden skapas.

Är du intresserad av att veta mer? Läs mer om Umeå universitet som arbetsplats.

Medicinska fakulteten är en av de största fakulteterna vid Umeå universitet och attraherar många studenter med ett omfattande utbud av utbildningar inom områdena medicin, tandvård, hälsa och vård. Vi erbjuder en väl utvecklad forskningsinfrastruktur och en inspirerande, dynamisk miljö med ledande forskning. Vår nära samverkan med de fyra regionerna i Norra sjukvårdsregionen ser vi som en stor ömsesidig tillgång för att utveckla forskning och utbildning och att säkra tillgången på vår framtids vårdpersonal.

Forskningsingenjör till Clinical Genomics Umeå

Institutionen för medicinsk biovetenskap tillhör medicinska fakulteten vid Umeå universitet (www.medbio.umu.se) och bedriver forskning och undervisning inom ämnena Klinisk kemi, Medicinsk och klinisk genetik samt Patologi. Institutionen har ca 90 anställda. 

Vi utlyser en anställning som forskningsingenjör till Umeånoden inom Clinical Genomics, som är en forskningsinfrastruktur och en plattform inom Science for Life Laboratory. Clinical Genomics Umeå ger service och stöd till translationell forskning och bedriver utvecklingsarbete för nya metoder inom precisionsmedicin. Arbetet sker i tätt samarbete med Genomic Medicine Sweden/Genomic Medicine Center Norr och avdelningarna för klinisk mikrobiologi, klinisk genetik samt klinisk patologi inom Region Västerbotten. 

Anställningen är placerad i ”laboratoriehuset” i byggnad 6M, med direkt kontakt med sjukhuset, medicinska biblioteket och tandläkarhögskolan.

Arbetsuppgifter

Vi söker dig som vill applicera bioinformatiska färdigheter på prekliniska och kliniska forskningsfrågor. Arbetet innebär analys av storskaliga sekvensdataset (next-generation sequencing (NGS) eller long read) och andra molekylärgenetiska data för identifiering av genetisk variation samt analys av genexpression. Huvudsakliga arbetsuppgifter kommer att vara att skapa, utveckla och kvalitetssäkra bioinformatiska flöden, utveckla bioinformatiska verktyg, analysera olika typer av rådata och fungera som en kompetensresurs. Du kommer att arbeta både med forsknings- och utvecklingsprojekt. Ämnesområdena är till stor del cancer och ärftliga sjukdomar. 

Kvalifikationer

Examen på grund- eller avancerad nivå inom bioinformatik, bioteknik eller annan motsvarande utbildning relevant för anställningen. Dokumenterad erfarenhet av analys av storskaliga dataset, inklusive NGS-data. Goda programmeringskunskaper i Python och stor erfarenhet av att arbeta i Linuxmiljö. Vana att använda versionshanteringssystem, t.ex. Git. Erfarenhet av att använda analyshanteringsverktyg som Snakemake och Nextflow samt arbetsbelastningshanterare som Slurm.

Övriga önskvärda kvalifikationer

Vana av systemadministration. Erfarenhet av containerplattformar, t.ex Docker eller Apptainer. Programmeringskunskaper i R, Rust eller Go. Förståelse för och erfarenhet av att hantera säkerhetsaspekter som rör persondata och genetisk information.

Stor vikt kommer att läggas vid personlig lämplighet. Du skall vara kreativ, kunna ta egna initiativ och ta dig an varierande arbetsuppgifter på ett flexibelt och effektivt sätt samt ha förmågan att egenhändigt driva utvecklingsprojekt. Du bör ha goda kunskaper i tal och skrift på svenska och engelska.

Villkor

Anställningen är tills vidare och avser heltid. Tillträde snarast möjligt eller efter överenskommelse.

Ansökningsförfarande

Ansökan ska innehålla

Ett personligt brev som beskriver dina kvalifikationer och kompetensområden samt varför du är intresserad av anställningen.

Ett CV/meritförteckning inkluderande datum för examen.

·         Kopior av betyg, examensbevis samt eventuella övriga meriter som sökanden vill åberopa.

·         Namn och kontaktuppgifter till minst två referenspersoner.

 

Upplysningar

Närmare upplysningar lämnas av Linda Köhn, Head of Unit, Clinical Genomics Umeå, tel: +46703176915, e-post: linda.kohn@umu.se

 Ansökan, skriven på svenska eller engelska och i word- eller pdf-format, skall göras via e-rekryteringssystemet Varbi och vara inkommen senast 261104.

 Umeå universitet vill erbjuda en jämställd och jämlik miljö där öppna samtal mellan människor med olika bakgrund och perspektiv lägger grunden för lärande, skaparkraft och utveckling. Vi välkomnar därför personer med olika bakgrunder och erfarenheter att söka den aktuella anställningen.

Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av ytterligare jobbannonser.